Okulumuz Milli Eğitim Bakanlığının 19.09.1996 tarih ve 420/2544 sayılı oluru ile 1999 yılında 14 öğrenci ile Çankaya Mesleki Eğitim Merkezi olarak faaliyete başlamıştır.
2005 yılından itibaren okulun adı Çankaya İş Okulu olarak değişmiştir.
Daha sonra Çankaya Özel Eğitim Mesleki Eğitim Merkezi (Okulu) olarak ismi değişmiştir.
2016 yılından itibaren geçici olarak İbn-i Sina İşitme Engelliler Meslek Lisesinin zemin ve birinci katında hizmet vermeye başlamıştır.
03/12/2017 tarihinden itibaren valilik oluru ile İbni Sina İşitme Engelliler Meslek Lisesinin kullanmış olduğu bina okulumuza tahsis edilmiş olup bu tarihten itibaren eğitim öğretime devam etmektedir.
7 Temmuz 2018 tarih ve 30471 sayılı Özel Eğitim Hizmetleri Yönetmeliğine göre okulumuzun ismi ÇANKAYA ÖZEL EĞİTİM MESLEK OKULU olarak değiştirilmiştir.
Okulumuz hafif düzey zihinsel engelli öğrencilere mesleki eğitim veren ortaöğretim kurumudur.